Στις 8 Νοεμβρίου 1827 έφθασε στην Αγκόνα. Το διάστημα που έμεινε στην Αγκόνα φρόντισε να ενημερωθεί για τον αριθμό, τη κατάσταση, το επάγγελμα των Ελλήνων σε όλες τις Ευρωπαϊκές πρωτεύουσες. Κατόπιν αδικαιολόγητης και πολυήμερης καθυστέρησης, η Αγγλική κορβέτα Γούλφ έφθασε στην Αγκόνα στις 15 Δεκεμβρίου 1827. Χρησιμοποιήθηκε η κορβέτα Γούλφ γιατί το μόνο διαθέσιμο πολεμικό πλοίο Γουόρσπαϊτ δεν μπορούσε να αγκυροβολήσει στο λιμάνι της Αγκόνα. Τελικά την 1η Ιανουαρίου 1828 ο Καποδίστριας με την συνοδεία του, απέπλευσε από το λιμάνι της Αγκόνα. Τη συνοδεία του την αποτελούσαν ο Ιωάννης Δόμπολης, ο Ιάκωβος Ρίζος Νερουλός, ο Σταμάτης Βούλγαρης ταγματάρχης του Γαλλικού στρατού πολεοδόμος και μηχανικός, οι γραμματείς του Αμί Μπετάντ και Μπίτζο, ο Νικόλαος Μαυρομάτης, ο υπηρέτης του Μπρούνο και ο θαλαμηπόλος του Φρειδερίκος. Μεσοπέλαγα συνάντησαν το Γουόρσπαϊτ όπου και επιβιβάστηκαν. Η επιθυμία του Καποδίστρια, να προσκυνήσει τους τάφους των γονιών στην Κέρκυρα πριν αναλάβει την διακυβέρνηση της Ελλάδας, δεν εισακούστηκε. Το πλοίο με εντολή του Άγγλου ναυάρχου Κόδριγκτον κατευθύνθηκε στη Μάλτα. Εκεί ο Άγγλος ναύαρχος και ο Καποδίστριας είχαν την ευκαιρία να συζητήσουν. Ο Άγγλος ναύαρχος εντυπωσιάστηκε από την προσωπικότητα του Καποδίστρια σε σημείο μάλιστα που μεσολάβησε για να γίνει δεκτό το αίτημά του για οικονομική βοήθεια στην Ελλάδα. Στις 2 Ιανουαρίου το Γουόρσπαϊτ έβαλε πλώρη για την Ελλάδα με τη συνοδεία ενός Ρωσικού πλοίου την «Ελένη» και ενός Γαλλικού πλοίου την «Ηρα». Την Παρασκευή στις 6 Ιανουαρίου 1828 ο Καποδίστριας έφθασε στο Ναύπλιο. Λόγω της θαλασσοταραχής που επικρατούσε δεν μπόρεσε να προσεγγίσει την Αίγινα που ήταν ο αρχικός προορισμός.
